La secretaría está encargada de la planificación  y programación económica-financiera del sindicato, evaluando su situación patrimonial y promoviendo la toma de decisiones necesarias respecto a gastos, inversiones y recursos. Por otro lado es la encarga de  llevar a cabo el balance general, redactar informe y poner en conocimiento al secretariado y a la comisión revisora de cuenta de la situación económica-financiera de la institución. También está a su cargo la fiscalización de todo ingreso y/o egreso económico pertenecientes a pagos de cuota sindical, obligaciones de los bienes del sindicato, contribuciones, etc.